والهدف الرئيسي من المؤتمر الأويغورى العالمي هو تعزيز الديمقراطية وحقوق الإنسان والحرية، والسعى للحصول لحق تقرير المصير للشعب الأويغورى المسلم واستخدام الوسائل السلمية اللاعنفية، والديمقراطية لتحديد مستقبله السياسي.
التي تمثل كمنظمة شرعية والوحيدة للشعب الأويغورى المسلم في داخل تركستان الشرقية وخارجها على حد سواء. والمساعي إلى وضع مسار للتسوية سلمية لقضية تركستان الشرقية عن طريق الحوار والتفاوض.

والمؤتمر الأويغورى العالمي قد أعلنت نفسها حركة المعارضة اللاعنفية والسلمية ضد الاحتلال الصيني لتركستان الشرقية، وهى تلتزم معاهدة حقوق الإنسان الدولية المقبولة غير المشروطة، المنصوص عليها في الإعلان العالمي لحقوق الإنسان ويتمسك بالمبادئ الرئيسية للتعددية الديمقراطية وترفض الاستبداد والتعصب الديني والعرقى والإرهاب كأداة سياسة لتسوية القضايا والمسائل.